Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav1P27870 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav1P27870 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms