Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdk11bP24788 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk11bP24788 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms