Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp36P22893 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp36P22893 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms