Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tap1P21958 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tap1P21958 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms