Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VimP20152 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VimP20152 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VimP20152 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VimP20152 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VimP20152 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VimP20152 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VimP20152 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VimP20152 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VimP20152 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms