Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps6ka3P18654 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps6ka3P18654 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms