Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PtpraP18052 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpraP18052 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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