Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf271P15620 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf271P15620 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms