Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd44P15379 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd44P15379 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms