Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmnb1P14733 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmnb1P14733 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms