Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-D1P14427 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-D1P14427 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms