Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd1d1P11609 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd1d1P11609 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms