Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsbP10605 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsbP10605 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsbP10605 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms