Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp28P10078 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp28P10078 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms