Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatspereP0DP43 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms