Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3P09920 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms