Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a2P08122 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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