Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col3a1P08121 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col3a1P08121 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col3a1P08121 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col3a1P08121 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Col3a1P08121 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col3a1P08121 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Col3a1P08121 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col3a1P08121 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col3a1P08121 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms