Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06344 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06344 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06344 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06344 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06344 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06344 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06344 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06344 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms