Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P04224 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P04224 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04224 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04224 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms