Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamc1P02468 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc1P02468 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc1P02468 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms