Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01853 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01853 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01853 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01853 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01853 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01853 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01853 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01853 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01853 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01853 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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