Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01662 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01662 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01662 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01662 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01662 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01662 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01662 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01662 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01662 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01662 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01662 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01662 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01662 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01662 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01662 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01662 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01662 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms