Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01661 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01661 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01661 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01661 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01661 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01661 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01661 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01661 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01661 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01661 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01661 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01661 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01661 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01661 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01661 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01661 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01661 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms