Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp1O89090 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms