Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcn2O88968 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcn2O88968 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms