Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tom1O88746 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tom1O88746 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tom1O88746 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms