Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BlmO88700 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BlmO88700 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BlmO88700 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BlmO88700 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BlmO88700 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BlmO88700 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BlmO88700 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BlmO88700 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BlmO88700 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BlmO88700 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BlmO88700 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BlmO88700 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BlmO88700 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms