Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops6O88545 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops6O88545 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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