Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms