Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl22O88430 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccl22O88430 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccl22O88430 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl22O88430 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms