Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms