Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd46O88174 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd46O88174 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd46O88174 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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