Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrna4O70174 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chrna4O70174 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms