Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp10O55123 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms