Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrxO55103 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrxO55103 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrxO55103 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrxO55103 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrxO55103 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PrxO55103 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrxO55103 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrxO55103 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrxO55103 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrxO55103 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrxO55103 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrxO55103 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms