Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk1O54908 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk1O54908 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms