Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srpk2O54781 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms