Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf9O35739 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf9O35739 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf9O35739 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf9O35739 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf9O35739 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf9O35739 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf9O35739 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf9O35739 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms