Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edil3O35474 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edil3O35474 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms