Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt1O35449 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt1O35449 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrt1O35449 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrt1O35449 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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