Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Polr1aO35134 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr1aO35134 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr1aO35134 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr1aO35134 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Polr1aO35134 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms