Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LhbO09108 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LhbO09108 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LhbO09108 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LhbO09108 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LhbO09108 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LhbO09108 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LhbO09108 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms