Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sec22bO08547 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sec22bO08547 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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