Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna4O08542 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms