Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10428J3QNV7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms