Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim18J3QNP2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smim18J3QNP2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim18J3QNP2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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