Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20918J3QN17 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20918J3QN17 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms