Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930544D05RikJ3QK56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930544D05RikJ3QK56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms