Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pot1bH7BX60 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms